Verwarm de oven voor op 180 °C, bereid 15 muffinvormpjes voor en bekleed ze met papieren cupcakecupjes.
Doe het meel, de cacao, de suiker en het bakpoeder in een middelgrote kom. Meng en voeg de melk, het ei, de yoghurt, de olie en het vanille-extract toe. Klop met een garde tot een glad beslag en vul de muffinvormpjes voor ¾ van hun volume. Bak 20–22 minuten op 180 °C.
Laat de muffins na het bakken 30 minuten afkoelen in de cupjes (bij voorkeur op een rooster). Klop ondertussen in een kleine kom de pindakaas met de honing glad met een garde.
Neem de afgekoelde muffins één voor één en schep voorzichtig met een lepeltje langs de rand een holte uit, zodat de bodem intact blijft en het binnenste in één stuk blijft, zodat het na het vullen met de pindakaascrème terug in de muffin gedrukt kan worden.
Vul elke muffin met ca. 1 theelepel crème. Dek de gevulde muffin af met het uitgeschepte deel en serveer.